Eigentlich alles ganz einfach. Der Webhoster lässt seinen Webspace per Confixx verwaltet, bietet Cronjobs an und jeder Nutzer kann sich seine Backups per Confixx erstellen.
Warum es nun zwar möglich ist Backups direkt auf einen von Nutzer eingestellten FTP zu spielen, aber keinerlei automatische Konfiguration (à la jede Woche ein Vollbackup) möglich ist, verstehe ich nicht so ganz.
Nach ein bisschen Google hat sich die Sache aber auch erledigt, denn ein simples PHP-Script übernimmt die automatischen Backups per Confixx.
In meinem Fall konnte das Script nicht auf dem Server ausgeführt werden, welcher gesichert werden soll, da die Confixxwebsite nicht Lokal aufrufbar war.
Viel Spaß beim Sichern!
Neue Version, welche auch Mails sichern kann:
https://gist.github.com/2626652